同济大学新农村发展研究院农副产品安全及深加工研究所，负责人：司慧萍

同济大学新农村发展研究院农业环境工程研究所，负责人：沈峥

同济大学新农村发展研究院农业信息技术研究所，负责人：吴军辉

同济大学新农村发展研究院设施农业技术研究所，负责人：陈杰

同济大学新农村发展研究院生态园区与景观规划研究所，负责人：杨学军

同济大学新农村发展研究院同济大学生态园，负责人：张亚雷