国家设施农业工程技术研究中心成立于2011年1月，由同济大学现代农业科学与工程研究院、上海都市绿色工程有限公司联合建设，将为设施农业领域的技术进步和推广应用发挥重要作用。“中心”的研究方向包括：设施农业装备标准化设计、制造、安装和新型建造材料研究；设施农业设计、建造和管理中的节能及新能源供能研究；设施农业绿色高效种、养殖技术及专用品种培育研究；设施农业中的环境控制技术研究等。现代农业科学与工程研究院是由学校多个优势学科交叉组成的现代农业学科平台，“国产化智能温室及其环境控制系统等配套设施的研制”项目2005年获教育部科技进步一等奖、2007年获国家科技进步二等奖。“国家设施农业工程技术研究中心”的建设将充分利用同济大学相关优势学科已有的科研设备和学术环境，更好地推进设施农业和相关学科力量的整合，发挥同济大学在工程领域中的多学科综合优势，提升同济农业工程学科特色和创新水平。